预付款保函是指银行对承包人进行担保的一种方式，银行开出符合业务要求的预付款保函后，承包人收到预付款，但并未按照合同执行项条款，未按时供货或者施工，业主这时提供相关证据，可向银行提起索赔，银行有见索即付的义务。
承包人自己可以在银行开付余款保函，看承包人在银行的授信如何，授信好的保证金比例
比较低，授信不好的保证金比例比较高，甚至是全额保证金。
在承包工程中，业主为了避免承包商违约失控而蒙受损失，通常要求承包商提供经济担保，这是买方市场的特点之一，也是国际公认的业主采取的防范措施。因此，承包商必须根据合同的有关规定，向业主提交各类保证金。而银行保函是由银行开立的承担付款责任的一种担保凭证，银行根据保函的规定承担付款责任。银行保函大多属于“见索即付”(无条件保函)，是不可撤销的文件。银行保函的当事人有委托人(要求银行开立保证书的一方)、受益人(收到保证书并凭此向 银行索偿的一方)、担保人(保函的开立人)。
工程保证担保引入保证人作为第三方，对建设工程中一系列合同的履行进行监督并对违约承担责任，是一种促使参与工程建设各方守信履约的风险管理机制。开发商、承包商、保证人三者之间形成保证担保关系。开发商和承包商是合同的主体，在不同的担保品种下，设定一方为被保证人，另一方为权益人（受益人、监管人），在被保证人不履行合同义务给权益人造成损失的情况下，权益人（监管人）可以要求保证人承担保证责任。
银行保函是指银行应委托人的申请而开立的有担保性质的书面承诺文件，一旦委托人未按其与受益人签订的合同的约定偿还债务或履行约定义务时，由银行履行担保责任。它有以下两个特点：
1.保函依据商务合同开出，但又不依附于商务合同，具有独立法律效力。当受益人在保函项下合理索赔时，担保行就必须承担付款责任，而不论委托人是否同意付款，也不管合同履行的实际事实。即保函是独立的承诺并且基本上是单证化的交易业务。
2.银行信用作为保证，易于为合同双方接受。