经过上述初级阶段的榨取之后，毛棕榈油和毛棕榈仁油被送到精炼厂精炼，经过去除游离脂肪酸、天然色素、气味后，成为色拉级的油脂-精炼棕榈油（RBD PO）及棕榈油色拉油（RBD PKO）。
经过精炼的棕榈油在液态下接近于无色透明，在固态下近白色。此外根据不同用户的需求，棕榈油还可以经过进一步的分馏、处理，形成棕榈油酸（PFAD）、棕榈液油（简称OLEAN）、棕榈硬脂（简称STEARINE或ST）。
棕榈油在常温下呈半固态，其稠度和熔点在很大程度上取决于游离脂肪酸的含量。市场上常把低酸值的棕榈油叫做软油，高酸值的油则叫做硬油。
在运输和卸货时的注意事项：，罐的涂料采用环氧树脂，在装油前要对罐的清洁进行检查。第二，用惰性气体喷布和覆盖。第三，油的装载不外溅。第四，船运期间油温保持在32-40℃。装货前加热油使其温度上升，速率每24小时不超过5℃。第五，油的装船温度不超过55℃。第六，脱臭棕榈油运到终点时，在那里装入涂有环氧树脂的油罐中并充入氮气。